Gino Biotech is al meer dan 10 jaar een belangrijke leverancier van hydrocolloïden voor voedingsmiddelen. Met onze verscheidenheid aan plantaardige gommen en stabilisatoren kunnen we op maat gemaakte hydrocolloïdoplossingen creëren die perfect zijn afgestemd op de behoeften van onze klanten. [LEES VERDER
Wat is Agarose? Een uitgebreide gids voor beginners
Wat is agarose?
Facebook
Twitter
LinkedIn
Agarose is een populair materiaal in laboratoria voor moleculaire biologie dat vaak wordt gebruikt voor het scheiden van DNA fragmenten door gelelektroforese.
Het is een polysacharide dat wordt gewonnen uit roodwieren, met name uit de celwanden van soorten uit de geslachten Gelidium, Gracilaria en Pterocladia.
In dit artikel gaan we dieper in op wat agarose is, de eigenschappen ervan en de toepassingen op verschillende gebieden.
1. Wat is agarose?
Agarose is een sterk gezuiverde polysacharide die wordt geïsoleerd uit agar, een gelachtige substantie die voorkomt in rood zeewier.
Het is een medium dat vaak gebruikt wordt in laboratoria voor moleculaire biologie voor verschillende toepassingen zoals gelelektroforese, DNA-scheiding en proteïnezuivering.
Agarose is een lineair polymeer van D-galactose en 3,6-anhydroïde-L-galactose-eenheden die met elkaar verbonden zijn door glycosidebindingen.
2. Chemische eigenschappen van agarose
Wat is het moleculaire gewicht van agarose? Agarose is een zeer stabiele en biocompatibele stof met een moleculair gewicht van ongeveer 120.000 Dalton.
Het is onoplosbaar in de meeste organische oplosmiddelen, maar kan worden opgelost in kokend water of bufferoplossingen.
De sterkte van agarosegel wordt voornamelijk bepaald door de concentratie agarose in de gelmatrix.
Gels met een lage concentratie (bijv. 0,5-1%) kunnen grote DNA-fragmenten scheiden, terwijl gels met een hoge concentratie (bijv. 2-3%) worden gebruikt om kleine DNA-fragmenten te scheiden.
3. Hoe wordt agarose bereid?
Agarose wordt meestal bereid door het uit rood zeewier te extraheren met behulp van een reeks chemische en fysische methoden.
Dit voorbereidingsproces omvat het wassen, malen en koken van de algen om de agar te extraheren, gevolgd door het zuiveren van de agar met behulp van filtratie- en precipitatietechnieken.
Agarose wordt verkregen door hydrolyse van de gezuiverde agar, die verder wordt gezuiverd door ionenwisselingschromatografie.
4. Agarosegelelektroforese
Agarosegelelektroforese is een veelgebruikte methode om DNA-fragmenten te scheiden op basis van hun grootte.
De methode bestaat uit het laden van DNA-monsters op een agarose gel, gevolgd door het aanbrengen van een elektrisch veld op de gelmatrix.
De DNA-fragmenten migreren door de gelmatrix op basis van hun grootte, waarbij kleinere fragmenten verder reizen dan grotere fragmenten.
De geïsoleerde DNA-fragmenten kunnen vervolgens gevisualiseerd worden met verschillende kleuringstechnieken, zoals ethidiumbromide of SYBR-groen.
5. Gebruik van agarose in de moleculaire biologie
Agarose wordt veel gebruikt in de moleculaire biologie voor verschillende toepassingen zoals DNA-isolatie, PCR-amplificatie en proteïnezuivering.
Het is een populair DNA-gelelektroforesemedium voor het isoleren van DNA-fragmenten voor analyse of zuivering.
Agarose wordt ook gebruikt als een matrix voor eiwitzuivering, waarbij eiwitten worden gescheiden op basis van hun grootte en lading met behulp van technieken zoals grootte-exclusiechromatografie of ionenuitwisselingschromatografie.
6. Gebruik van agarose in de biotechnologie
- Agarose wordt gebruikt in verschillende biotechnologische toepassingen, zoals de productie van agarosekorrels, die worden gebruikt als vaste drager voor verschillende biomoleculen zoals enzymen of antilichamen.
- Agarosekorrels worden ook gebruikt in affiniteitschromatografie, waarbij biomoleculen worden gescheiden op basis van hun specifieke bindingskenmerken.
- Daarnaast kan agarose worden gebruikt voor eiwitzuivering met technieken zoals chromatografie met uitsluiting van grootte of ionenuitwisselingschromatografie.
- Agarose wordt ook vaak gebruikt als medium voor de elektroforese van DNA en RNA, waardoor nucleïnezuurfragmenten kunnen worden gescheiden en geanalyseerd.
7. Agarose-toepassingen in de medische wetenschap
- Agarose wordt ook gebruikt in de medische wetenschap voor verschillende toepassingen, zoals systemen voor het toedienen van medicijnen en weefselmanipulatie.
- Agarosehydrogels kunnen worden gebruikt als scaffolds voor weefselmanipulatie en bieden een 3D-matrix voor cellen om te groeien en te differentiëren.
- De hydrogel kan ook worden gebruikt als drager voor het toedienen van geneesmiddelen en het geneesmiddel komt vrij als de hydrogel afbreekt. De functie is vergelijkbaar met die van een capsule.
8. Voordelen en nadelen van agarose
Agarose heeft verschillende voordelen ten opzichte van andere scheidingsmaterialen zoals polyacrylamide gels of celluloseacetaat.
Lage toxiciteit, gemakkelijk te hanteren en gemakkelijk te bereiden in het laboratorium.
Agarosegels hebben ook een hoog oplossend vermogen, waardoor DNA-fragmenten zeer nauwkeurig gescheiden kunnen worden.
Agarose heeft echter een aantal nadelen, zoals het beperkte oplossend vermogen voor kleine DNA-fragmenten en de neiging om te breken onder stress.
9. Agarose versus andere scheidingsmaterialen
Agarose is slechts een van de materialen die gebruikt worden om DNA-fragmenten te scheiden.
Polyacrylamide gels en celluloseacetaat zijn ook veelgebruikte materialen, maar elk heeft zijn eigen voor- en nadelen.
Polyacrylamide gels
Vergeleken met agarosegels hebben polyacrylamidegels een hoger oplossend vermogen en kunnen ze worden gebruikt om kleinere DNA-fragmenten te scheiden, maar ze hebben het nadeel dat ze moeilijker te bereiden en te hanteren zijn.
Celluloseacetaatgels
Celluloseacetaatgels zijn ook gemakkelijk te bereiden en te hanteren, maar hebben een lager oplossend vermogen dan agarosegels.
Conclusie
FAQs
Wat is het verschil tussen agar en agarose?
Agar is een gelachtige substantie die voorkomt in rood zeewier en bevat een mengsel van agarose en agarpectine.
Agarose is een sterk gezuiverde vorm van agar die wordt gebruikt in de moleculaire biologie en biotechnologie.
Wat zijn de soorten agarose?
Agarose is verkrijgbaar in verschillende kwaliteiten, afhankelijk van de zuiverheid en eigenschappen.
Laag smeltpunt, lage elektro-endophorese, regelmatige sterkte, hoge sterkte, enz.
Wat is agarose met een laag smeltpunt?
Agarose met een laag smeltpunt is een type agarose dat smelt bij een lagere temperatuur dan standaard agarose, waardoor het ideaal is voor toepassingen waarbij de gel na gebruik gesmolten moet worden, zoals bij DNA-extractie.
Wat is agarose met een lage EEO?
Agarose met lage EEO-waarde heeft een zeer lage EEO-waarde en wordt aanbevolen voor analytische en preparatieve gels met een zeer goede resolutie voor nucleïnezuurfragmenten groter dan 1000 bp (zelfs kleiner dan 1000 bp bij hogere concentraties).
Wat is de verpakking van je agarose?
- 10 kg kartonnen doos
- 100 g/fles, dan 5 kg kartonnen doos
- 25 kg trommel
Wat zijn de voordelen van agarose?
Agarose heeft verschillende voordelen die het een ideale keuze maken voor biologische toepassingen. De biocompatibiliteit, niet-giftigheid en niet-immunogene eigenschappen maken het veilig voor gebruik in celkweken en andere biologische toepassingen. Het vermogen om gels te vormen die kunnen worden aangepast voor de poriegrootte maakt het een uitstekend medium voor het scheiden van biomoleculen op basis van grootte. Agarose is ook gemakkelijk te gebruiken, waardoor het een populaire keuze is in onderzoekslaboratoria.
Kan agarose worden gebruikt voor eiwitzuivering?
Ja, agarose kan worden gebruikt als een matrix voor eiwitzuivering met technieken zoals grootte-exclusiechromatografie of ionenuitwisselingschromatografie.
Gerelateerd Artikelen
Recente berichten
Over Gino Biotech
Wij zijn een biotechbedrijf dat gespecialiseerd is in het onderzoek naar, de ontwikkeling en commercialisering van innovatieve en technologische voedingsadditieven hydrocolloïden. Agar Agar, Carrageen, en Stabilisatoroplossingen op maat.
Met de uitgebreide knowhow en ervaring in het onderzoek, de toepassing en het gebruik van hydrocolloïden, kunnen we een one-stop-shop bieden aangepaste oplossingen perfect afgestemd op de behoeften van onze klanten.
Onze producten voldoen aan de behoeften van de vlees-, zuivel-, bakkerij-, banketbakkerij- en andere industriële sectoren.
Neem contact op met onze vertegenwoordiger voor meer informatie.