Agarose ist ein beliebtes Material in molekularbiologischen Labors, das üblicherweise zur Trennung von DNA Fragmente durch Gelelektrophorese.
Es handelt sich um ein Polysaccharid, das aus Rotalgen gewonnen wird, insbesondere aus den Zellwänden von Arten der Gattungen Gelidium, Gracilaria und Pterocladia.
In diesem Artikel werden wir einen ausführlichen Blick darauf werfen, was Agarose ist, welche Eigenschaften sie hat und wie sie in verschiedenen Bereichen eingesetzt wird.
Agarose ist ein hochgereinigtes Polysaccharid, das aus Agar isoliert wird, einer gelartigen Substanz, die in Rotalgen vorkommt.
Es ist ein Medium, das in molekularbiologischen Labors für verschiedene Anwendungen wie Gelelektrophorese, DNA-Trennung und Proteinreinigung verwendet wird.
Agarose ist ein lineares Polymer aus D-Galaktose- und 3,6-anhydrischen L-Galaktose-Einheiten, die durch glykosidische Bindungen miteinander verbunden sind.
Wie hoch ist das Molekulargewicht von Agarose? Agarose ist eine sehr stabile und biokompatible Substanz mit einem Molekulargewicht von etwa 120.000 Dalton.
Es ist in den meisten organischen Lösungsmitteln unlöslich, kann aber in kochendem Wasser oder Pufferlösungen aufgelöst werden.
Die Stärke des Agarosegels wird hauptsächlich durch die Konzentration der Agarose in der Gelmatrix bestimmt.
Gele mit niedriger Konzentration (z. B. 0,5-1%) können große DNA-Fragmente trennen, während Gele mit hoher Konzentration (z. B. 2-3%) zur Trennung kleiner DNA-Fragmente verwendet werden.
Agarose wird in der Regel durch Extraktion aus Rotalgen mit einer Reihe von chemischen und physikalischen Verfahren hergestellt.
Dieser Aufbereitungsprozess umfasst das Waschen, Zerkleinern und Kochen der Algen, um den Agar zu extrahieren, gefolgt von der Reinigung des Agars durch Filtrations- und Ausfällungstechniken.
Agarose wird durch Hydrolyse des gereinigten Agars gewonnen, das durch Ionenaustauschchromatographie weiter gereinigt wird.
Die Agarosegel-Elektrophorese ist eine weit verbreitete Methode zur Auftrennung von DNA-Fragmenten auf der Grundlage ihrer Größe.
Bei dieser Methode werden DNA-Proben auf ein Agarosegel geladen und anschließend ein elektrisches Feld an die Gelmatrix angelegt.
Die DNA-Fragmente wandern je nach ihrer Größe durch die Gelmatrix, wobei kleinere Fragmente weiter wandern als größere Fragmente.
Die isolierten DNA-Fragmente können dann mit verschiedenen Färbetechniken, wie Ethidiumbromid oder SYBR-Grün, sichtbar gemacht werden.
Agarose wird in der Molekularbiologie für verschiedene Anwendungen wie DNA-Isolierung, PCR-Verstärkung und Proteinreinigung eingesetzt.
Es ist ein beliebtes Medium für die DNA-Gelelektrophorese zur Isolierung von DNA-Fragmenten für die Analyse oder Aufreinigung.
Agarose wird auch als Matrix für die Proteinreinigung verwendet, bei der Proteine nach Größe und Ladung mit Techniken wie der Größenausschlusschromatographie oder der Ionenaustauschchromatographie getrennt werden.
Agarose hat mehrere Vorteile gegenüber anderen Trennmaterialien wie Polyacrylamidgelen oder Celluloseacetat.
Geringe Toxizität, einfache Handhabung und einfache Zubereitung im Labor.
Agarosegele haben außerdem ein hohes Auflösungsvermögen, so dass sich DNA-Fragmente mit hoher Genauigkeit trennen lassen.
Agarose hat jedoch einige Nachteile, wie z. B. ihr begrenztes Auflösungsvermögen für kleine DNA-Fragmente und ihre Neigung, unter Stress zu brechen.
Agarose ist nur eines von mehreren Materialien, die zur Trennung von DNA-Fragmenten verwendet werden.
Polyacrylamid-Gele und Celluloseacetat sind ebenfalls häufig verwendete Materialien, die jedoch jeweils ihre eigenen Vor- und Nachteile haben.
Im Vergleich zu Agarosegelen haben Polyacrylamidgele ein höheres Auflösungsvermögen und können zur Trennung kleinerer DNA-Fragmente verwendet werden, haben aber den Nachteil, dass sie schwieriger herzustellen und zu handhaben sind.
Celluloseacetatgele sind ebenfalls einfach herzustellen und zu handhaben, haben aber ein geringeres Auflösungsvermögen als Agarosegele.
Agar ist eine gelartige Substanz, die in Rotalgen vorkommt und eine Mischung aus Agarose und Agarpectin enthält.
Agarose ist eine hoch gereinigte Form von Agar, die in der Molekularbiologie und Biotechnologie verwendet wird.
Agarose gibt es in verschiedenen Qualitäten, je nach ihrer Reinheit und ihren Eigenschaften.
Niedriger Schmelzpunkt, geringe Elektroendophorese, gleichmäßige Festigkeit, hohe Festigkeit, usw.
Agarose mit niedrigem Schmelzpunkt ist eine Agaroseart, die bei einer niedrigeren Temperatur schmilzt als Standardagarose und sich daher ideal für Anwendungen eignet, bei denen das Gel nach der Verwendung geschmolzen werden muss, wie z. B. bei der DNA-Extraktion.
Low EEO-Agarose hat einen sehr niedrigen EEO-Wert und wird für analytische und präparative Gele mit sehr guter Auflösung für Nukleinsäurefragmente mit einer Größe von mehr als 1000 bp (bei höheren Konzentrationen sogar weniger als 1000 bp) empfohlen.
Agarose hat mehrere Vorteile, die sie zu einer idealen Wahl für biologische Anwendungen machen. Ihre Biokompatibilität, Nicht-Toxizität und nicht-immunogenen Eigenschaften machen sie sicher für den Einsatz in Zellkulturen und anderen biologischen Anwendungen. Ihre Fähigkeit, Gele zu bilden, deren Porengröße eingestellt werden kann, macht sie zu einem ausgezeichneten Medium für die Trennung von Biomolekülen nach ihrer Größe. Agarose ist außerdem einfach zu handhaben, was sie zu einer beliebten Wahl in Forschungslabors macht.
Ja, Agarose kann als Matrix für die Proteinreinigung mit Techniken wie Größenausschlusschromatographie oder Ionenaustauschchromatographie verwendet werden.
Agar vs. Agarose
Agarose-Pulver
Niedrige EEO-Agarose
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